殺菌滅藻劑可以分為氧化型殺生劑（如CI2、CIO2、漂粉精、過(guò)氧化物）和非氧化型殺生劑（如潔爾滅、洗必泰、季銨鹽等）。

氧化型殺生劑是具有強(qiáng)烈氧化性的殺生藥劑，通常是一種強(qiáng)氧化劑，對(duì)水中微生物的殺生作用很強(qiáng)，鹵素中的氯、溴和碘，還有氯的化合物、臭氧等都是氧化型殺生劑。溴和碘由于成本太高，無(wú)法用于大規(guī)模的工業(yè)生產(chǎn)上。工業(yè)上常用的是氯、次氯酸鈉和次氯酸鈣等。氧化型殺生劑對(duì)水中其他還原性物質(zhì)能起氧化作用，故當(dāng)水中存在有機(jī)物、硫化氫及亞鐵離子時(shí)，會(huì)消耗一部分殺生劑，降低了它的殺生效果。這時(shí)如采用的是氯及其化合物，則因需氯量的增加而使氯耗提高。

非氧化型殺生劑不以氯化作用殺死微生物，而是以致毒劑作用于微生物的特殊部位，因而非氧化型殺生劑不受水中還原性物質(zhì)的影響。常用的非氧化型殺生劑有胺類、季銨鹽類、二硫氰基甲烷及大蒜素等。

選用殺生劑時(shí)可以根據(jù)不同水質(zhì)特點(diǎn)、不同時(shí)期的具體情況，選用氧化型或非氧化型殺生劑，有時(shí)還采用二者交替使用。